بررسی پلی مورفیسمهای موجود در مناطق RD در سابتایپهای مختلف مایکوباکتریوم توبرکلوزیس
فصلنامه نفس,
دوره 1 شماره 2 (1393),
6 شهریور 2014
چکیده
بیماری سل به عنوان یکی از بیماریهای تاثیرگذار بر روی سلامت و بهداشت جهانی شناخته میشود. فهم شیوه انتقال و شیوع و بررسی فاکتورهای میزبان و همچنین خصوصیات و فاکتورهای باکتری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس که میتوانند در شیوع بیماری سل تاثیر داشته باشند برای مدیریت شیوع و کنترل و مبارزه با این بیماری بسیار حیاتی میباشد. در همین راستا و برای به دست آوردن این اطلاعات استفاده از تکنیکهای مولکولی و روشهای اپیدمیولوژی بسیار ضروری هستند. یکی از روشهایی که امروزه مورد مطالعات بسیار قرار گرفته، بررسی مناطق ژنی موسوم به ناحیه تفاوت (RD) میباشد که در این مطالعه به بررسی این مناطق میپردازیم.
ابتدا 190 سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روشهای اسپولیگوتایپینگ شناسایی شدند. مقاومت دارویی این سویهها مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت 6 لوکوس RD مورد نظر از جنبه حذف (Deletion) در ژنوم این 190 سویه با روش PCR مورد بررسی و آنالیز قرار گرفتند.
از سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روش اسپولیگوتایپینگ، H4(127) در72 نمونه (5/37%)، CAS در 37 مورد (20%)،T1 در 18 نمونه (5/9%) و Beijing در 11 مورد شناسایی شدند و باقی نمونهها شامل 52 مورد (27%) ناشناخته بودند. 70% نمونهها حساس به دارو و 30% مقاوم بودند. در سویههای Beijing، لوکوسهای RD181 و RD105 و در سویه BCG لوکوسRD1 ، حذف داشتند.
بررسی مناطق RD روشی ساده و سریع است. استفاده از RD1 جهت شناسایی سویه BCG و همچنین RD181 جهت شناسایی سویه Beijing مناسب میباشد اما RD150 به علت عدم وجود پلیمورفیسم در سویههای مختلف کارایی چندانی بهعنوان یک روش اپیدمیولوژی ندارند. همچنین در این تحقیق مشخص شد که مقاومت دارویی ارتباطی با حذف در مناطق RD ندارد.
- اپیدمیولوژی ملکولی
- سل
- اسپولیگوتایپینگ
- ناحیه تفاوت
ارجاع به مقاله
- چکیده مشاهده شده: 79 بار
- PDF دانلود شده: 28 بار